MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 6182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000909	A	6	6	38	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000909	TTTA	2	8	67	74	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000909	AATTT	2	10	84	93	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000909	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000909	ATTA	2	8	165	172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000909	GTAA	2	8	174	181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000909	TAT	2	6	244	249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000909	GAAA	2	8	251	258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000909	TAT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000909	AGT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000909	TGA	2	6	343	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000909	TAT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000909	GGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000909	ATTA	2	8	444	451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000909	TGA	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000909	AATAG	2	10	698	707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000909	T	6	6	762	767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000909	AGA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000909	GAA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000909	AGC	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000909	TCA	2	6	1056	1061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000909	TTG	2	6	1119	1124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000909	AGT	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000909	ATA	3	9	1311	1319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000909	CTT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000909	TTAAA	2	10	1334	1343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000909	CCT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_000909	T	7	7	1387	1393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000909	ACA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000909	ATA	3	9	1591	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000909	CTT	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_000909	TTAAA	2	10	1614	1623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000909	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000909	ACC	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_000909	TTC	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000909	AAT	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000909	T	6	6	1786	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000909	C	6	6	1820	1825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_000909	A	6	6	1872	1877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000909	A	6	6	1940	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000909	A	6	6	2008	2013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000909	ATT	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000909	TTA	2	6	2096	2101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000909	TTA	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000909	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000909	AGA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000909	TAAAA	2	10	2196	2205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000909	ATT	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000909	GTA	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000909	T	6	6	4146	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000909	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000909	GGT	2	6	4193	4198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000909	TTAA	2	8	4252	4259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000909	TTGT	2	8	4273	4280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000909	ATTG	2	8	4287	4294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000909	AT	3	6	4296	4301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000909	TTG	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000909	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000909	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000909	ATTAT	2	10	4448	4457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000909	GCT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000909	AAACA	2	10	4470	4479	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_000909	CTAT	2	8	4488	4495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000909	TTTAA	2	10	4571	4580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000909	AT	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000909	TG	3	6	4685	4690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000909	GAT	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000909	T	6	6	4703	4708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000909	T	6	6	4730	4735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000909	TA	3	6	4747	4752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000909	ATT	2	6	4793	4798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000909	ATA	2	6	4803	4808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000909	TTTA	2	8	4816	4823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000909	TA	3	6	4822	4827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000909	TCA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_000909	ATTT	2	8	4874	4881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000909	TA	3	6	7294	7299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000909	T	6	6	8589	8594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000909	TAT	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000909	AT	3	6	8623	8628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000909	AT	3	6	8649	8654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000909	TAC	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_000909	ATT	3	9	8676	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000909	TAC	2	6	8716	8721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_000909	TAT	2	6	8722	8727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000909	AAGAT	2	10	8766	8775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000909	A	7	7	8814	8820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000909	TTA	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000909	TAA	2	6	8853	8858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000909	TTCT	2	8	10007	10014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000909	TTA	2	6	10027	10032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000909	AT	3	6	10042	10047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000909	TA	3	6	10053	10058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000909	GA	3	6	11575	11580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000909	GCTTC	2	10	13558	13567	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_000909	ATC	2	6	13625	13630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_000909	AACTCC	2	12	13652	13663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_000909	T	6	6	13673	13678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000909	CTC	2	6	13690	13695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_000909	ACA	2	6	13839	13844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_000909	AGTT	2	8	13879	13886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000909	TAA	2	6	14002	14007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000909	T	6	6	14022	14027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000909	T	6	6	14042	14047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000909	AAT	2	6	14049	14054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000909	T	6	6	14075	14080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000909	ATAG	2	8	14081	14088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000909	GGTAT	2	10	14103	14112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000909	CT	3	6	14119	14124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000909	GAT	2	6	14173	14178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000909	AAC	2	6	14216	14221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_000909	TAA	2	6	14231	14236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000909	T	6	6	14246	14251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000909	TTA	2	6	14257	14262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000909	T	6	6	14304	14309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000909	TCTA	2	8	15471	15478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_000909	AT	3	6	15479	15484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000909	ATA	2	6	15817	15822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000909	TGT	2	6	15882	15887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000909	TGT	2	6	15889	15894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000909	GTTT	2	8	15986	15993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000909	T	6	6	16028	16033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000909	CTT	2	6	16036	16041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_000909	T	6	6	16059	16064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000909	ATT	2	6	16143	16148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000909	AGCGA	2	10	16429	16438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_000909	TAA	2	6	16469	16474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000909	AT	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000909	ATT	2	6	16551	16556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000909	AG	3	6	16566	16571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000909	TC	3	6	16576	16581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_000909	TTA	2	6	16642	16647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000909	T	6	6	16673	16678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000909	T	6	6	16701	16706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000909	AT	3	6	16711	16716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000909	TA	3	6	16731	16736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000909	GA	3	6	16753	16758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000909	AAGTT	2	10	16764	16773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000909	A	6	6	16791	16796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000909	TAA	2	6	16797	16802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000909	ATA	2	6	17463	17468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000909	TAA	2	6	17482	17487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000909	AT	3	6	17493	17498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000909	ATA	2	6	17501	17506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000909	TA	3	6	17505	17510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000909	AT	3	6	17527	17532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000909	A	6	6	17545	17550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000909	TAA	3	9	17553	17561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000909	TA	3	6	17578	17583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000909	GAAA	2	8	17591	17598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000909	A	6	6	17596	17601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000909	AT	3	6	17604	17609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000909	AT	3	6	17632	17637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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